1、关于教皇的权势巨子：上帝教认为教皇在宗教事务上具有更高权势巨子，教皇以教皇身份发布的对宗教事务的决定具有最末约束力，对所有上帝教徒具有约束力。基督教其实不承受教皇权势巨子，而且没有任何机构或小我在基督教具有类似权势巨子。
2、教会传统和圣经：基督教认为圣经具有更高权势巨子，但上帝教认为圣经只是教会传统的一部门。
3、上帝教认为玛丽亚出生时并没有原功，而基督教认为玛丽亚同其别人不异。
4、忏悔礼的有效性：上帝教认为只要神职人员能够代表天主赦宥人的功，完成忏悔礼必需要神职人员的参与。而基督教认为人人皆祭司，所有人都能够间接向天主祈祷，哀告赦宥。
5、组织上所有上帝教属于统一个教会，而基督教一般是相对独立的教会或者宗派。
