次要区别在于：地址、车站代码、建立时间、建筑面积、站台规模。
1、详细地址纷歧样。
昆明站位于昆明市官渡区北京路1号。
昆明南站位于昆明市呈贡区吴家营街道白龙潭山脚之西。
2、车站代码纷歧样。
昆明站代码为48197。
昆明南站代码为48794。
3、建立时间纷歧样。
昆明站于1966跟着贵昆铁路的通车启用，2004年12月28日新客站扩建工程完工，2005年1月1日正式投入运营。
昆明南站于2011年6月20日开建；2015年12月，车站站房主体工程落成；2016年12月28日，车站正式投入利用。
4、建筑面积纷歧样（截至2016年12月）。
昆明站建筑面积为25000平方米。
昆明南站建筑面积为33.47万平方米。
5、站台规模纷歧样（截至2016年12月）。
昆明站站台规模为6台12线。
昆明南站站台规模为16台30线。
