目前，南京地铁已经开通并运营了十条地铁路线。下面是除了编号开头为S的路线之外的路线运营时间。
一号线始发站迈皋桥的首班车出发时间是5:42，末班车出发时间是23:19；始发站药科大学的首班车出发时间是6:47:48，末班车出发时间是00:27:28。
二号线始发站经天路的首班车出发时间是6:00，末班车出发时间是23:00；始发站油坊桥的首班车出发时间是6:57:17，末班车是23:56:57。
三号线始发站秣周东路的首班车出发时间是6:00，末班车出发时间是23:10；始发站林场的首班车出发时间是6:59:14，末班车出发时间是0:09:14。
四号线始发站仙林湖的首班车出发时间是6:00，末班车出发时间是23:00；始发站龙江的首班车出发时间是6:43:33，末班车出发时间是23:42:38。
十号线始发站雨山路的首班车出发时间是5:40，末班车出发时间是23:00；始发站安德门的首班车出发时间是6:31:56，末班车是0:11:56。
