虽然碘伏和碘酒都是用作外科消毒杀菌的，但是两者并不是一回事。碘伏和碘酒的主要区别就在于它们的溶媒不一样，所以其用途也有一些区别。
碘酒的学名为碘酊，它是以乙醇(酒精)为溶媒，以碘、碘化钾为主要成分的红棕色液体。通常用于皮肤感染和消毒。碘酊的色泽会随着浓度的增加而变深，浓度越高其消毒杀菌的效果就越强，但是相应的其刺激性也会越强。而且在使用后必须用浓度为75%的酒精进行脱碘，否则就会导致皮肤被灼伤。
碘酒的缺点主要集中于它的刺激性带来的对人体皮肤组织的伤害。由于其过于强大的腐蚀性，在消毒时即使是正常的皮肤组织也会受到损伤而导致留疤。正是由于碘酒的这一缺点，导致了其正在逐渐被碘伏所取代的局面的出现。
碘伏是以水为溶媒的淡棕色溶液。其消毒能力相较碘酒较弱。但是由于碘伏是以水作为溶媒的，其刺激性也相应的比碘酒弱很多。所以在三甲医院，碘伏的运用范围比碘酒广得多，既可以处理挫伤、擦伤、切割伤、冻伤、烧伤等各种外伤，又可以用于专业的手术消毒。市面上常见的就是5%的碘伏，这种碘伏安全又有效。在对外阴生殖器、口腔黏膜、小儿皮肤等比较敏感的部位进行消毒时都可以使用碘伏进行处理。
在选购家用的消毒药剂时最好还是选择碘伏，因为它在消毒的效果上已经足够应付一般的使用场景，而且较之碘酒更加温和安全。
